MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	GCG	2	6	24	29	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021839	AAG	2	6	54	59	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021839	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021839	AAAG	2	8	101	108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021839	CGG	2	6	198	203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021839	GGA	2	6	230	235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021839	AGT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	TTG	2	6	415	420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021839	AAGGT	2	10	528	537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021839	TACT	2	8	540	547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021839	CACG	2	8	561	568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021839	TC	3	6	634	639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021839	ACC	2	6	813	818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021839	AT	3	6	834	839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021839	AGC	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021839	TGG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021839	AAG	2	6	1095	1100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021839	TAGGCG	2	12	1187	1198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021839	ACA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021839	AGTG	2	8	1300	1307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	GGAA	2	8	1354	1361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021839	AGT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021839	GAG	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	GA	3	6	1475	1480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021839	GA	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021839	CGG	2	6	1712	1717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021839	GA	3	6	1810	1815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021839	TAGG	2	8	1928	1935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021839	GAG	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021839	TGG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021839	TAC	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021839	CCT	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021839	ATGG	2	8	2111	2118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021839	GGT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021839	TCG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021839	CGT	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021839	GAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021839	AC	3	6	2485	2490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021839	GTT	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021839	TG	3	6	2536	2541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021839	C	6	6	2577	2582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_021839	TTC	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021839	GAT	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021839	ATCG	2	8	2689	2696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021839	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021839	TCT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021839	GA	3	6	2756	2761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021839	CAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021839	ATT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021839	T	7	7	2931	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021839	ATAA	2	8	2949	2956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021839	TAGG	2	8	2965	2972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021839	AGTCAA	2	12	3001	3012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021839	A	6	6	3021	3026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021839	AAG	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
56	NC_021839	ATTA	2	8	3164	3171	50 %	50 %	0 %	0 %	525929674
57	NC_021839	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
58	NC_021839	GTG	4	12	3225	3236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
59	NC_021839	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929674
60	NC_021839	ATGA	2	8	3263	3270	50 %	25 %	25 %	0 %	525929674
61	NC_021839	TC	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	525929674
62	NC_021839	GAA	3	9	3362	3370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
63	NC_021839	TAA	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
64	NC_021839	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
65	NC_021839	TGG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
66	NC_021839	TTTACC	2	12	3430	3441	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525929674
67	NC_021839	TGA	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021839	GAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
69	NC_021839	CAA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929675
70	NC_021839	CT	4	8	3630	3637	0 %	50 %	0 %	50 %	525929675
71	NC_021839	CTT	2	6	3691	3696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929675
72	NC_021839	AGA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929675
73	NC_021839	TTGT	2	8	3735	3742	0 %	75 %	25 %	0 %	525929675
74	NC_021839	ATT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929675
75	NC_021839	A	6	6	3863	3868	100 %	0 %	0 %	0 %	525929675
76	NC_021839	GAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929675
77	NC_021839	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929675
78	NC_021839	TGA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
79	NC_021839	AATG	2	8	4032	4039	50 %	25 %	25 %	0 %	525929675
80	NC_021839	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
81	NC_021839	GAT	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
82	NC_021839	GTT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
83	NC_021839	GAAG	2	8	4161	4168	50 %	0 %	50 %	0 %	525929676
84	NC_021839	TTG	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
85	NC_021839	ATA	2	6	4178	4183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929676
86	NC_021839	TGA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
87	NC_021839	TGG	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929676
88	NC_021839	ATG	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
89	NC_021839	GAA	2	6	4327	4332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
90	NC_021839	TAT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
91	NC_021839	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
92	NC_021839	TG	3	6	4495	4500	0 %	50 %	50 %	0 %	525929676
93	NC_021839	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	525929676
94	NC_021839	ACA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929676
95	NC_021839	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	525929676
96	NC_021839	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
97	NC_021839	ATT	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
98	NC_021839	AAG	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
99	NC_021839	A	6	6	4925	4930	100 %	0 %	0 %	0 %	525929676
100	NC_021839	TGAA	2	8	4931	4938	50 %	25 %	25 %	0 %	525929676
101	NC_021839	T	6	6	4962	4967	0 %	100 %	0 %	0 %	525929676
102	NC_021839	GAGAA	2	10	4968	4977	60 %	0 %	40 %	0 %	525929676
103	NC_021839	AGA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
104	NC_021839	ATG	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
105	NC_021839	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021839	ACA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021839	ATG	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
108	NC_021839	AAG	2	6	5136	5141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
109	NC_021839	GAACA	2	10	5172	5181	60 %	0 %	20 %	20 %	525929677
110	NC_021839	TTA	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929677
111	NC_021839	GCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
112	NC_021839	CT	3	6	5229	5234	0 %	50 %	0 %	50 %	525929677
113	NC_021839	GCA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
114	NC_021839	GAC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
115	NC_021839	A	6	6	5336	5341	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
116	NC_021839	GAACA	2	10	5394	5403	60 %	0 %	20 %	20 %	525929677
117	NC_021839	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
118	NC_021839	ACAA	2	8	5539	5546	75 %	0 %	0 %	25 %	525929677
119	NC_021839	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
120	NC_021839	GAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
121	NC_021839	CAA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
122	NC_021839	TGT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
123	NC_021839	GTG	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
124	NC_021839	A	6	6	5864	5869	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
125	NC_021839	TATT	2	8	5907	5914	25 %	75 %	0 %	0 %	525929677
126	NC_021839	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
127	NC_021839	GCC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929677
128	NC_021839	GTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
129	NC_021839	CAA	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
130	NC_021839	AT	3	6	6046	6051	50 %	50 %	0 %	0 %	525929677
131	NC_021839	TGC	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
132	NC_021839	GA	3	6	6071	6076	50 %	0 %	50 %	0 %	525929677
133	NC_021839	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
134	NC_021839	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
135	NC_021839	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
136	NC_021839	TGA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
137	NC_021839	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
138	NC_021839	A	6	6	6350	6355	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
139	NC_021839	AGC	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
140	NC_021839	A	6	6	6428	6433	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
141	NC_021839	AGA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
142	NC_021839	AGA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
143	NC_021839	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
144	NC_021839	GTT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
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164	NC_021839	TGA	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021839	TA	3	6	8059	8064	50 %	50 %	0 %	0 %	525929678
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243	NC_021839	GTACGT	2	12	11493	11504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525929682
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270	NC_021839	TAAT	2	8	12944	12951	50 %	50 %	0 %	0 %	525929682
271	NC_021839	TGAA	2	8	12954	12961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021839	T	6	6	12987	12992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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